Han pasado dos años desde el final del "sucesor marciano Nadesico". Akito y Yurika han desaparecido. Los jovianos y los terrícolas se han unido y Ruri ahora es el capitán de Nadesico B.
A medida que crece la popularidad de Boson Jumping, se ha desarrollado una gran red de transporte. Apodado el Plan Hisago, esta red de portales de Chulip contiene las respuestas a los misterios detrás de las partículas de Bose y su poder. Si esos secretos caen en las manos equivocadas, podría significar un gran problema. Y hay un gran problema.
Un grupo escindido marciano ha lanzado una ofensiva, dejando a las Fuerzas Unidas aturdidas y desesperadas. Tanto es así, de hecho, que la antigua tripulación del Nadesico es llamada de vuelta al servicio activo para una misión especial no autorizada: para salvarnos a todos. ¿Tiene esta colección de inadaptados lo que se necesita? ¿Quién ganará la carrera por la tecnología Boson? ¿Y qué diablos le pasó a Akito y Yurika?
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